La final de la Copa Mercosur 1999 fue disputada entre el Palmeiras y el Flamengo, ambos de Brasil. El Palmeiras llegaba por segunda vez a la final de la Copa Mercosur y buscaba ganarla de manera consecutiva y convertirse en bicampeón del torneo. Mientras que el Flamengo llegaba por primera vez a la final de la Copa Mercosur y buscaba ganarla por primera vez.
La final de ida se jugó el 16 de diciembre de 1999 en el Estadio Maracaná en donde el Flamengo le ganaría por 4 a 3 al Palmeiras. La final de ida se jugó el 20 de diciembre de 1999 en el Parque Antártica en donde ambos equipos igualarían 3 a 3, resultado que le permitía al Flamengo consagrarse campeón, además de dar la vuelta olímpica —debido a que tenía más puntos—. Siendo la primera vuelta olímpica de la Copa Mercosur.
Era la segunda vez que dos equipos de un mismo país jugaban la final de la Copa Mercosur, motivo por el cual todos los partidos de la final se jugaron en Brasil.
Finalistas
Enfrentamientos
Tabla de posiciones en la final
Resultados
Detalles
Alineaciones
Ida
Vuelta
